サ变动词

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サ变动词，举个例子，“申請する”这个サ变动词，我看到的更多的是使用“申請をする”这种用他动词来表现的形式，请问这是一种使用偏好吗？还是意思上有些微妙的差别？麻烦会的先辈指导一下。

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觉得很微妙啊!

認定申請をする。
認定を申請する。

株式公開を申請した。
株式公開に関しては、もう申請をした。

申請する　一个动作。
申請をするする是动作，申請是动作的作用对象。