幕府は寺院法度をだし、宗派ごとに本山?本寺の地

幕府は寺院法度をだし、宗派ごとに本山?本寺の地位を保証して末寺を組織させ、1665年には宗派を超えた仏教寺院の僧侶全体を共通に統制するために諸宗寺院法度をだした。また同年、神社神職に対しても諸社禰宜神主法度を制定して統制した。